MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019777	A	6	6	209	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019777	TAT	2	6	237	242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019777	T	6	6	1208	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019777	T	7	7	1229	1235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019777	ATT	2	6	1575	1580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019777	AAAT	2	8	1616	1623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019777	TAAA	2	8	2013	2020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019777	TTA	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019777	AT	3	6	2059	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019777	A	7	7	2086	2092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019777	GCG	2	6	2103	2108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019777	A	6	6	2112	2117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019777	A	9	9	2120	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019777	T	6	6	2132	2137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019777	TTTTA	2	10	2141	2150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019777	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019777	TAA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019777	TAA	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019777	ATAA	2	8	5982	5989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019777	TCAC	2	8	5991	5998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019777	ATT	2	6	6000	6005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019777	ATC	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019777	A	7	7	6068	6074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019777	TATT	2	8	6088	6095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019777	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019777	ATAA	2	8	6168	6175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019777	AT	3	6	6176	6181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019777	TAA	2	6	6182	6187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019777	TAA	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019777	ATA	2	6	6254	6259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019777	AATAA	2	10	6260	6269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019777	TTCT	2	8	6296	6303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019777	TAA	2	6	8972	8977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019777	T	7	7	9926	9932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019777	TCC	2	6	10595	10600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019777	CCA	2	6	10729	10734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019777	TCA	2	6	10784	10789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019777	AATTT	2	10	10793	10802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019777	A	8	8	10856	10863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019777	TAA	2	6	10864	10869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019777	CAAG	2	8	10887	10894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019777	TCA	2	6	10895	10900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019777	TAT	2	6	10917	10922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019777	AAT	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019777	CTC	2	6	10968	10973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019777	TTTTG	2	10	10985	10994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019777	TAA	2	6	11041	11046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019777	AG	3	6	11088	11093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019777	AGTA	2	8	11137	11144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019777	ATA	2	6	11158	11163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019777	TTG	2	6	11176	11181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019777	TAA	3	9	11245	11253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019777	AAT	2	6	11341	11346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019777	TAGA	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019777	CTTA	2	8	11442	11449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019777	TA	3	6	11448	11453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019777	AAT	2	6	11841	11846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019777	AAT	2	6	12947	12952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019777	TATAA	2	10	12970	12979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019777	TGGA	2	8	12992	12999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019777	ATTT	2	8	13002	13009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019777	TAA	2	6	13798	13803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019777	TG	4	8	13816	13823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019777	TCG	2	6	14099	14104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019777	ATT	2	6	14110	14115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019777	T	6	6	14161	14166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019777	ACTA	2	8	14200	14207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019777	ATC	2	6	14519	14524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019777	GCG	2	6	14528	14533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019777	CCA	2	6	14618	14623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019777	TA	3	6	14745	14750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019777	GTC	3	9	14838	14846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019777	TAT	2	6	14906	14911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019777	A	6	6	14916	14921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019777	CTT	2	6	14969	14974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019777	GGA	2	6	14985	14990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019777	ACT	2	6	15000	15005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019777	GA	3	6	15028	15033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019777	TAG	2	6	15039	15044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019777	ATA	2	6	15056	15061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019777	GAT	2	6	15130	15135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019777	ATTT	2	8	15235	15242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019777	TAT	2	6	16197	16202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019777	ATC	2	6	16207	16212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019777	ATA	2	6	16256	16261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019777	CTA	2	6	16277	16282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019777	T	6	6	17205	17210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019777	CACTTT	2	12	17219	17230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019777	TAT	2	6	17236	17241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019777	ATT	2	6	18687	18692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019777	TTTCCT	2	12	18717	18728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019777	GTT	2	6	19082	19087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019777	ATG	2	6	19169	19174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019777	GTTT	2	8	19203	19210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019777	GTA	2	6	19220	19225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019777	CATC	2	8	19291	19298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019777	AAT	2	6	19302	19307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019777	TTAA	2	8	19316	19323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019777	ACT	2	6	19334	19339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019777	TTTA	2	8	19356	19363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019777	AATAA	2	10	19392	19401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019777	T	6	6	19431	19436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019777	AAAT	2	8	19448	19455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019777	TGA	2	6	19461	19466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019777	T	7	7	19468	19474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019777	TTA	2	6	19477	19482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019777	GTT	2	6	19515	19520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019777	GA	3	6	19526	19531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019777	GTT	2	6	19532	19537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019777	CATC	2	8	20195	20202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019777	ATT	2	6	20231	20236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019777	ATTAA	2	10	22391	22400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019777	A	9	9	22406	22414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019777	ACAA	2	8	22429	22436	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019777	ATA	2	6	22437	22442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019777	TAT	2	6	22445	22450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019777	AGT	2	6	22461	22466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019777	AGTT	2	8	22547	22554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019777	A	6	6	22579	22584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019777	A	6	6	22587	22592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019777	GTTTT	2	10	25684	25693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019777	ATT	2	6	25716	25721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019777	AATC	2	8	25733	25740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019777	A	6	6	27791	27796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019777	TGT	2	6	27800	27805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019777	CT	3	6	27809	27814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019777	GAA	2	6	27834	27839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019777	TCT	2	6	27850	27855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019777	TAT	2	6	27868	27873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019777	ATT	2	6	27962	27967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019777	ATA	2	6	28618	28623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019777	T	6	6	28627	28632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019777	AT	3	6	28662	28667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019777	TAA	2	6	29382	29387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019777	ATT	2	6	31173	31178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019777	TC	3	6	32507	32512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019777	ATT	2	6	32620	32625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019777	GTTTT	2	10	32691	32700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019777	AT	4	8	32759	32766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019777	ATT	2	6	32782	32787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019777	TC	3	6	32794	32799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019777	TGG	2	6	33001	33006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019777	TC	3	6	33020	33025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019777	CTGAC	2	10	33056	33065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019777	A	6	6	33085	33090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019777	TC	4	8	33093	33100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019777	GAAA	2	8	33160	33167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019777	CTC	2	6	33168	33173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_019777	TC	3	6	33475	33480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.